Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EGFRP00533 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EGFRP00533 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EGFRP00533 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EGFRP00533 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EGFRP00533 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EGFRP00533 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EGFRP00533 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EGFRP00533 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EGFRP00533 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EGFRP00533 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EGFRP00533 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EGFRP00533 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EGFRP00533 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EGFRP00533 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EGFRP00533 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EGFRP00533 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EGFRP00533 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EGFRP00533 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EGFRP00533 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EGFRP00533 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EGFRP00533 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EGFRP00533 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EGFRP00533 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EGFRP00533 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EGFRP00533 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EGFRP00533 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EGFRP00533 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EGFRP00533 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EGFRP00533 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EGFRP00533 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EGFRP00533 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EGFRP00533 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EGFRP00533 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EGFRP00533 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EGFRP00533 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EGFRP00533 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EGFRP00533 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EGFRP00533 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EGFRP00533 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EGFRP00533 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EGFRP00533 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EGFRP00533 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EGFRP00533 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EGFRP00533 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EGFRP00533 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EGFRP00533 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EGFRP00533 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EGFRP00533 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EGFRP00533 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EGFRP00533 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EGFRP00533 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EGFRP00533 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EGFRP00533 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EGFRP00533 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EGFRP00533 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EGFRP00533 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
EGFRP00533 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EGFRP00533 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EGFRP00533 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EGFRP00533 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EGFRP00533 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EGFRP00533 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EGFRP00533 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms