Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APBA3O96018 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APBA3O96018 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APBA3O96018 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APBA3O96018 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APBA3O96018 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APBA3O96018 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APBA3O96018 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APBA3O96018 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APBA3O96018 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APBA3O96018 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APBA3O96018 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APBA3O96018 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APBA3O96018 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APBA3O96018 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APBA3O96018 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APBA3O96018 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APBA3O96018 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
APBA3O96018 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
APBA3O96018 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APBA3O96018 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APBA3O96018 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APBA3O96018 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APBA3O96018 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APBA3O96018 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APBA3O96018 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
APBA3O96018 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APBA3O96018 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
APBA3O96018 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APBA3O96018 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APBA3O96018 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APBA3O96018 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APBA3O96018 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
APBA3O96018 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APBA3O96018 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
APBA3O96018 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA3O96018 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA3O96018 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA3O96018 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA3O96018 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA3O96018 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA3O96018 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA3O96018 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA3O96018 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA3O96018 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA3O96018 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA3O96018 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA3O96018 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APBA3O96018 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APBA3O96018 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APBA3O96018 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
APBA3O96018 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APBA3O96018 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
APBA3O96018 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APBA3O96018 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APBA3O96018 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APBA3O96018 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
APBA3O96018 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
APBA3O96018 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
APBA3O96018 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
APBA3O96018 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APBA3O96018 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
APBA3O96018 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
APBA3O96018 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APBA3O96018 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APBA3O96018 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APBA3O96018 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APBA3O96018 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APBA3O96018 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APBA3O96018 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APBA3O96018 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APBA3O96018 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APBA3O96018 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
APBA3O96018 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APBA3O96018 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APBA3O96018 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
APBA3O96018 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA3O96018 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA3O96018 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA3O96018 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA3O96018 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA3O96018 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA3O96018 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA3O96018 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA3O96018 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA3O96018 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APBA3O96018 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APBA3O96018 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms