Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP29O95721 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms