Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms