Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN7O95471 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms