Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRATO95237 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRATO95237 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRATO95237 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRATO95237 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRATO95237 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRATO95237 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRATO95237 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRATO95237 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRATO95237 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRATO95237 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRATO95237 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRATO95237 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRATO95237 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRATO95237 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRATO95237 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRATO95237 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRATO95237 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRATO95237 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRATO95237 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRATO95237 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRATO95237 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRATO95237 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRATO95237 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRATO95237 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRATO95237 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRATO95237 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LRATO95237 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRATO95237 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRATO95237 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRATO95237 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRATO95237 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRATO95237 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRATO95237 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRATO95237 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRATO95237 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRATO95237 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRATO95237 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRATO95237 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRATO95237 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRATO95237 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms