Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA4O75676 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms