Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms