Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms