Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN11O75508 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN11O75508 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms