Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN5O75503 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN5O75503 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN5O75503 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN5O75503 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN5O75503 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN5O75503 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN5O75503 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN5O75503 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN5O75503 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN5O75503 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN5O75503 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN5O75503 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN5O75503 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN5O75503 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN5O75503 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN5O75503 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN5O75503 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN5O75503 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN5O75503 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN5O75503 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN5O75503 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN5O75503 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN5O75503 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms