Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNA1O75449 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNA1O75449 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms