Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP12O75317 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP12O75317 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP12O75317 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP12O75317 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP12O75317 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP12O75317 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP12O75317 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP12O75317 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP12O75317 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP12O75317 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP12O75317 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP12O75317 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP12O75317 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP12O75317 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP12O75317 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP12O75317 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP12O75317 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP12O75317 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP12O75317 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP12O75317 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP12O75317 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP12O75317 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP12O75317 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP12O75317 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP12O75317 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP12O75317 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP12O75317 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP12O75317 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP12O75317 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP12O75317 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP12O75317 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP12O75317 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP12O75317 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP12O75317 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP12O75317 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP12O75317 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP12O75317 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP12O75317 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms