Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED4O75132 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms