Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX2O60749 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX2O60749 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX2O60749 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX2O60749 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX2O60749 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX2O60749 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX2O60749 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX2O60749 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX2O60749 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX2O60749 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX2O60749 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX2O60749 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX2O60749 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX2O60749 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX2O60749 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX2O60749 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX2O60749 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX2O60749 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX2O60749 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX2O60749 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX2O60749 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX2O60749 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX2O60749 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX2O60749 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX2O60749 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX2O60749 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX2O60749 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX2O60749 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX2O60749 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX2O60749 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX2O60749 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX2O60749 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX2O60749 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX2O60749 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX2O60749 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX2O60749 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX2O60749 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX2O60749 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX2O60749 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX2O60749 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX2O60749 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX2O60749 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX2O60749 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX2O60749 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX2O60749 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX2O60749 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX2O60749 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms