Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms