Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORBS3O60504 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SORBS3O60504 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORBS3O60504 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms