Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B3O60423 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms