Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN3BO60391 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms