Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCMT2O60294 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCMT2O60294 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LCMT2O60294 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCMT2O60294 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCMT2O60294 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCMT2O60294 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCMT2O60294 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms