Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms