Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP9O43818 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP9O43818 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP9O43818 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP9O43818 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP9O43818 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP9O43818 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP9O43818 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP9O43818 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP9O43818 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP9O43818 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP9O43818 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP9O43818 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP9O43818 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRP9O43818 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRP9O43818 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRP9O43818 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRP9O43818 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRP9O43818 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRP9O43818 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRP9O43818 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP9O43818 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP9O43818 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP9O43818 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP9O43818 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP9O43818 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP9O43818 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP9O43818 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP9O43818 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP9O43818 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP9O43818 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP9O43818 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP9O43818 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP9O43818 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP9O43818 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP9O43818 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP9O43818 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP9O43818 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP9O43818 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP9O43818 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP9O43818 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP9O43818 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP9O43818 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP9O43818 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP9O43818 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP9O43818 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP9O43818 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP9O43818 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP9O43818 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP9O43818 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP9O43818 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP9O43818 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP9O43818 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP9O43818 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP9O43818 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP9O43818 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP9O43818 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP9O43818 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP9O43818 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRP9O43818 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRP9O43818 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRP9O43818 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRP9O43818 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRP9O43818 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRP9O43818 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRP9O43818 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RRP9O43818 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRP9O43818 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRP9O43818 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP9O43818 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP9O43818 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP9O43818 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP9O43818 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP9O43818 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP9O43818 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP9O43818 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms