Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF3O43395 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms