Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms