Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms