Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPL2O15504 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUPL2O15504 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms