Protein–RNA interactions for Protein: O15213

WDR46, WD repeat-containing protein 46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46O15213 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR46O15213 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR46O15213 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR46O15213 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR46O15213 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR46O15213 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR46O15213 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR46O15213 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR46O15213 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR46O15213 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR46O15213 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR46O15213 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR46O15213 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR46O15213 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR46O15213 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR46O15213 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR46O15213 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR46O15213 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR46O15213 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR46O15213 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR46O15213 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR46O15213 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR46O15213 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR46O15213 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR46O15213 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR46O15213 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR46O15213 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR46O15213 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
WDR46O15213 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR46O15213 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR46O15213 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR46O15213 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR46O15213 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR46O15213 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR46O15213 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR46O15213 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR46O15213 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR46O15213 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR46O15213 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR46O15213 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR46O15213 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR46O15213 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR46O15213 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR46O15213 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR46O15213 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR46O15213 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR46O15213 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR46O15213 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR46O15213 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR46O15213 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR46O15213 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR46O15213 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR46O15213 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR46O15213 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR46O15213 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR46O15213 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR46O15213 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR46O15213 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR46O15213 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR46O15213 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR46O15213 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR46O15213 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR46O15213 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR46O15213 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR46O15213 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR46O15213 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR46O15213 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR46O15213 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR46O15213 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR46O15213 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR46O15213 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR46O15213 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR46O15213 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms