Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD9O15198 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD9O15198 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms