Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNJ2O15056 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ2O15056 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms