Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LIN7AO14910 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms