Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC80O14777 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC80O14777 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC80O14777 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NDC80O14777 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NDC80O14777 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC80O14777 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC80O14777 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC80O14777 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC80O14777 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC80O14777 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC80O14777 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC80O14777 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC80O14777 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC80O14777 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC80O14777 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC80O14777 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC80O14777 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC80O14777 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC80O14777 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC80O14777 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC80O14777 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC80O14777 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC80O14777 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC80O14777 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC80O14777 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC80O14777 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC80O14777 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC80O14777 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms