Protein–RNA interactions for Protein: O14524

NEMP1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1O14524 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP1O14524 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP1O14524 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP1O14524 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP1O14524 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP1O14524 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP1O14524 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP1O14524 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP1O14524 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP1O14524 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms