Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
O00370 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
O00370 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
O00370 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
O00370 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
O00370 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
O00370 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
O00370 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
O00370 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
O00370 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
O00370 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
O00370 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
O00370 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
O00370 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
O00370 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
O00370 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
O00370 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
O00370 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
O00370 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
O00370 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
O00370 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
O00370 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
O00370 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
O00370 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
O00370 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
O00370 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
O00370 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
O00370 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
O00370 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
O00370 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
O00370 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
O00370 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
O00370 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
O00370 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
O00370 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
O00370 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
O00370 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
O00370 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
O00370 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
O00370 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
O00370 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
O00370 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
O00370 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
O00370 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
O00370 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
O00370 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
O00370 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
O00370 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
O00370 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
O00370 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
O00370 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
O00370 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
O00370 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
O00370 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
O00370 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
O00370 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
O00370 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
O00370 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
O00370 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
O00370 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
O00370 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
O00370 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
O00370 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
O00370 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
O00370 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms