Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMD12O00232 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMD12O00232 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMD12O00232 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD12O00232 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD12O00232 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms