Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK2O00142 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TK2O00142 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TK2O00142 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TK2O00142 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TK2O00142 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TK2O00142 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK2O00142 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK2O00142 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TK2O00142 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK2O00142 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK2O00142 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK2O00142 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK2O00142 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK2O00142 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK2O00142 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK2O00142 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TK2O00142 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TK2O00142 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TK2O00142 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TK2O00142 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TK2O00142 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TK2O00142 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TK2O00142 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TK2O00142 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TK2O00142 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK2O00142 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TK2O00142 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TK2O00142 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TK2O00142 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TK2O00142 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TK2O00142 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TK2O00142 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TK2O00142 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TK2O00142 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TK2O00142 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TK2O00142 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TK2O00142 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK2O00142 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TK2O00142 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TK2O00142 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TK2O00142 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TK2O00142 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TK2O00142 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TK2O00142 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TK2O00142 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TK2O00142 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TK2O00142 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms