Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H7C1H1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H7C1H1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H7C1H1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H7C1H1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H7C1H1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H7C1H1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H7C1H1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H7C1H1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H7C1H1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms