Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO7DNF2Z398 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms