Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms