Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms