Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DIRC3C9JPN6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DIRC3C9JPN6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms