Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT4C9JH25 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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