Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM49D1C9J1S8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM49D1C9J1S8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms