Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5BA8MYB1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5BA8MYB1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5BA8MYB1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5BA8MYB1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5BA8MYB1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5BA8MYB1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5BA8MYB1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5BA8MYB1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms