Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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