Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA8JA6NMD2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms