Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms