Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms