Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms