Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRAMEF27A3QJZ7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PRAMEF27A3QJZ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms