Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms